В 1872 году японский медик Arinobu Fukuhara основал компанию Shiseido Pharmacy. Компания занималась разработкой и выпуском косметической и парфюмерной продукцией. Shiseido Pharmacy проводит исследования в области дерматологии и одними из первых выпускают смягчающий лосьон для кожи Eudermine, который и сейчас является одним из лучших.

В 1917 году компания ломает привычное представление японцев и выпускает пудру для лица Rainbow Face Powder, в отличии от традиционно белой пудры новая разработка имеет в своей линейке семь оттенков. С 1923 года компания стремительно расширяется увеличивая свой рынок сбыта, открывая новые магазины. На данный момент сеть магазинов бренда Shiseido насчитывает более двадцати пяти тысяч торговый точек по всему миру. Уже с 1968 года косметику Shiseido представляют на широкое обозрения требовательному потребителю в Европе. Где она стала очень популярна. Разработки и исследования компании ведутся постоянно. И вот в 1985 году компания выпускает первую гиалоурановую кислоту не животного происхождения, что позволило бренду занять лидирующую позицию в мировой косметологии.

Параллельно с косметологией бренд занимается выпуском парфюмерной продукции. Благодаря сотрудничеству с Serge Lutens, в парфюмерной индустрии, бренд Shiseido представлен несколькими парфюмами: Nombre Noir, Feminite du Bois, Zen, а также Basara.